
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
设计成果
理论研究人员管理探究性随着日期推移保温日期延长了用时牛羊肉的对抗强度、持反击式水轮机、成色、分散铁含氧量、ROS、脂质过硫化物、MDA、GSH和GPX4标准来评价腹肌阻止細胞的铁伤亡的情形。毕竟提示,保温日期延长了用时后,牛羊肉的对抗强度在第3天和第6天有效性消减;持水水平消减;颜色等等变深,失去了光亮,鲜蓝色转换成暗蓝色。虽然,分散铁、活力性氧和MDA的含氧量有效性加大,細胞凋亡率有效性变高。 探讨人士截取各不相同保鲜冷库周期的腿部手臂肌肉备样英文的球核苷酸,以后对其进行SDS-PAGE分折,球核苷酸条带在各不相同晚清时期生长竖直且相同(图1a)。依据球胆固醇在各不相同备样英文中的表达出状态,分折发现了指定组备样英文的中十位数比较敏感于指定级别(图1b),就说明腿部手臂肌肉备样英文球核苷酸兼具充分的组内相同性和组间不一致性性。 淀粉酶质组学共监定出1996种淀粉酶质。以B0为對照组,选择B1、B2、B4和B6中的淀粉酶完成其他表答数据概述,共监定到376个DEPs。将火山图web3d,并选择FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两只规范标准数据概述DEP。然而如1c-f如图是,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别监定出22、33、73和140个DEPs,但其中分头别调整6、11、32和8九个,调整16、22、41和5二个。聚类分析法技巧分析评估了其他冷藏库时期全身手臂肌肉公司中淀粉酶质的表答,然而提示全身手臂肌肉淀粉酶表答其他不断地处理时长的增多而增多(图1g)。
图1| 有差异 保鲜冷库时间段的健身肌肉原辅料球营养素组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 多种保温时刻的身体肌肉原材料相互影响血清数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身故蛋白酶肽的PRM定量深入分析深入分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 针对KEGG聚集之间的关系表述淀粉酶的铁消亡新机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT化学发光法核脂肪酸组学技术性工艺产品于,拜谱生物学已研制搞定并制定了建立健全熟透的转录组学、核核蛋白组学、产生组学还有几组学联席物料技术性工艺产品于安全体系,欢迎致电咨询!
参考价值文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.