
近日,合肥医科大专业首位其他医生王学浩中科院院士组织在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向疗法卡路里分解代谢检测分析服务。
英文字母文章标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文版关键词:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
潜在客户机关单位:南京医科大学
调查食材:细胞
拜谱提供了服务的:转录组测序+球蛋白互作组+靶点力量分解组
工艺规划:
调查没想到
01、YBX1被评定为HCC中糖酵解的要素人类基因
本探究采集工具HCC癌症模板(n=7)的单細胞RNA测序数剧表格集完成研究,发觉糖酵解抗逆性包括集合在癌症細胞中,hdWGCNA研究面部识别出9个人类基因传感器(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的我的世界发展研究判定YBX1为自己我的世界发展的风险方面(图1H)。进步运用IHC、WB科学实验和癌症聚集与周围非癌症聚集的位置转录组学数剧表格集印证YBX1是肝細胞癌进行治疗的潜在性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被明确为调低HCC内部糖酵解的关键所在的因素
02、YBX1提高网站HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物激光能量排泄组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1推进HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1整合并利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,核蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1运用并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增加其磷酸性反应,而使带动其核转位
进每这一步检查测量YBX1的O-GlcNAc糖基化有无危害其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT抑制作用剂OSMI-1工作,YBX1血清酶平均程度偏态降,YBX1磷硝化作用偏态变少(图4A-C)。IP调查显现,在雷同的Flag-YBX1底物平均程度下,YBX1-WT的磷硝化作用平均程度偏态如果超过YBX1-T57A,揭示磷硝化作用的增多这样不不仅是这在于比较高的YBX1血清酶体现出来(图4D)。分离法了核和质多组分发掘TMG工作的HCC神经元中YBX1核体现出来的偏高(图4E-F),进每这一步发掘YBX1磷硝化作用的核心转换指数公式是AKT(图4G-I)。等等发掘注重O-GlcNAc糖基化利用激发其磷硝化作用来激发YBX1血清酶相对稳定处理并激发核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 绘制有益于其进那步发现磷硝化作用绘制并就能够催进其核转位
05、YBX1使得PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有助于PKM2转录
06、YBX1 才能从而提高组蛋清乳酸性反应突显情况
探索知道YBX1敲低更为明显影响核高血清乳碱化,愈加是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解压溶液剂2-DG的实验所确认了糖酵解与组核血清乳碱化的进行性相关联,压制糖酵解可更为明显影响H3K18la级别(图6D)。PKM2过表示方式可逆性转YBX1敲低而致的H3K18la的降低,到外源乳酸治理 一方面加强H3K18la,还周期性YBX1表示方式调涨,表明具备正向着报告(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR确认,H3K18la经由聚集于YBX1开启子进行性提高其转录,该步骤受O-GlcNAc糖基化宏观调控(图6H-J),并知道P300 调涨是YBX1不断增强H3K18乳酰凝成用的措施(图6K-L)。
图6.YBX1提升H3K18乳过酸呈现技术水平
文章内容个人总结
在这些项设计中媒体报道了YBX1在HCC中高把你想传达出来,或者与糖酵解秘切涉及到的。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,才能可靠淀粉酶质并增大其把你想传达出来。这些装饰还加速YBX1在T57处的磷碱化,加速其核易位。因为,这些进程资料了糖酵解涉及到的遗传什么是基因的转录并兴奋乳酸的引发。除此以外,YBX1成功激活P300的转录,于是驱动程序组淀粉酶的乳碱化,越来越是H3K18la,H3K18乳碱化领域监测YBX1遗传什么是基因转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传基因正反两面馈环原则图
拜谱工作小结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱怪物为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向药物动能细胞代谢组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、翻意后突显组学、细胞代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
基准毕业论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.