
2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱海洋生物为其提供m6A甲基化分析一下技术工艺工作,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。
散文品牌:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)
玩家机关单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院
调查建筑材料:小鼠脑组织
拜谱具备技术应用:m6A甲基化(MeRIP-seq)
提要图:
图1| 英文论文图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)
分析导致
1.DCI小鼠海马中m6A遗传基因表达的变更
探讨工人1设立了高脂食用和自我认同思维障碍(DCI)的小鼠3d模型。为会比较剖析组(n = 3)和DCI组(n = 3)之間的m6A表观遗传遮盖,探讨工人适用MeRIP-seq做好了转录组使用范围内的m6A-seq进行分析。在DCI组的10664个简码表观遗传转录物(mRNAs)中国共产党显示剖析组的2371一不重交叠叠的m6A峰。较之下,DCI组呈现出23,75一非重交叠叠m6A峰。里面,9349个甲基化表观遗传在剖析组和DCI组之間重交叠叠(图2)。
图2| 照表组和DCl组m6a体现染色体的维恩图
图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的变换
图4| 的差异甲基化m6A位点的通道丰度
2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据文件的联办概述
接着随后研究具体分析者将m6A MeRIP-Seq的大数据表格和原先RNA-Seq的大数据表格实施联手具体分析,得知163个mRNA,m6A峰和mRNA情况正相关该变。41种mRNA的m6A和mRNA情况调涨,14种mRNA情况下降。凡此种种,30个基因组组组mRNA呈现爱调涨,m6A情况下降,7八个基因组组组mRNA呈现爱下降,m6A情况调涨(图5A)。末尾,在校园营销推广活动的环节之中所构建一堆个PPI网路来体现163个基因组组组商品代码的蛋白酶范围内的衔接(图5B)。
图5| m6A甲基化与mRNA表达方式的综合研究分析
图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG概述
拜谱怪物总结ppt
本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱海洋生物提供了m6A甲基化方法服务管理,拜谱生物学可提供完善成熟的蛋白酶组学、产生组学、转录组学还有几组学结合的产品的技术保障,欢迎致电咨询!
基准学术论文:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.